兔子患有耳螨后使用含有伊维菌素成分的药物是最管用的。但需要购买兽用药物，不可用人用药，防止兔子中毒。一般建议先使用宠物洗耳液将兔子耳朵内的污物清理干净，然后涂抹含伊维菌素成分的耳螨药进行治疗，治疗周期通常为7-14天左右，在治疗期间需要按时给兔子上药，防止出现耐药性。
在发现兔子有耳螨时，要及时将患有耳螨的兔子隔离开，因为耳螨是有传染性的，如果继续和其它兔子待一起，必会一个传染两个，到时处理起来更麻烦。可以用干净的笼子暂时关养起患耳螨的兔子。然后开始对兔舍进行打扫，兔舍里的东西也全部拿出清洗干净，可以用消毒水进行消毒，或放在太阳底下暴晒。