猫咪在睡醒时摇头可能是因为它们在清醒时习惯于用头部动作来清理自己的耳朵。猫咪有时会在睡觉时也会做出这种动作，因为这是它们身体反射的一部分。这也可能是因为它们在睡眠中有一些梦境或幻觉，并且在梦境中的行为可能会反映在它们的身体动作中。
此外，猫咪也可能在睡醒时摇头是因为它们感到不舒服或受到了惊吓。例如，如果它们感到耳朵受到了压迫或有外界噪音打扰，它们可能会用头部动作来解决这些问题。总的来说，猫咪在睡醒时摇头可能是由多种因素引起的，包括生理反射、不舒服或惊吓等。如果您的猫咪经常在睡醒时摇头，并且伴随有其他异常症状，建议您咨询兽医。