猫三联和妙三多最主要的区别就是生产厂家不同，同时妙三多具有正规的进口批文，而猫三联没有。首先，猫三联和妙三多都是用来预防猫瘟、猫鼻支等传染性疾病，这两种疫苗临床的免疫效果没有太大差异。其次，在某些情况下，猫咪使用猫三联的过敏几率要比妙三多要高一些，这种情况需要及时更换疫苗。
妙三多属于传染病疫苗，只注射两针使体内抗体滴度较低，达不到抵抗病毒的效果，从而出现免疫失败。通常妙三多需要注射三针加强免疫，让体内抗体达到一定的滴度，以此抵抗病毒的侵袭。同时，每年需要再加强注射一针妙三多疫苗以更好地保护身体。给猫接种疫苗时，要确保它们的健康。