硝化细菌是一类可以利用氧化过程将氮气转化为氨或硝酸盐的细菌。它们通常存在于污染的水体或湿地中，并且可以在缺氧环境中进行代谢。
硝化细菌没有净水的功效，它只是可以分解氨氮和亚硝酸盐等对鱼有毒害作用的物质；抑制蓝藻、裸藻等有害藻类，但是它并不能分解大颗粒的杂质和藻类。正确的处理水质混浊、悬浮物多的办法是用一些EM菌（乳酸菌、酵母菌等）来分解和絮凝，搭配过滤系统将杂质过滤出去。
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