反硝化菌主要有假单胞菌属、产碱杆菌属这两种，反硝化细菌能生存于作氮源用的硝酸盐的介质中，它能利用这种化合物既可作为能量代谢，又可用于物质代谢。
反硝化菌也可以用在鱼缸里，它可以降低水里的亚硝酸盐，减轻亚硝酸盐对鱼儿的毒害，那么反硝化菌该如何培养呢，反硝化细菌如同腐生菌那样，从含碳化合物的广泛范围里氧化并建造自己的体内物质。在土壤中根的分泌物、死亡的植物根的残体及其分解的地上部，对这些微生物来说都是有机质的来源。
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