家禽混饲：治疗时每1000kg饲料添加清瘟败毒散3kg（即每袋拌料300kg），充分混匀，每天2次，连用3-5天。预防量减半；家畜 混饲：每1kg体重内服10-20g，连用5-7天，重症加倍或遵医嘱；畜禽混饮：用适量温开水浸泡20分钟后药液兑入全天饮水量的1/3或1/4水中集中饮用，药渣拌料，效果更佳，每天2次，连用3-5天。
清瘟败毒散在重用石膏的同时配合知母、甘草，意在清热保津，与犀角(水牛角)、生地、赤芍、丹皮相配，意在凉血散瘀，清热解毒;配合黄连、黄芩、栀子意在通泻三焦火热;连翘、玄参可散浮游之火，桔梗、竹叶载药上行，14味药物共奏清瘟败毒之功。