巨头刺颈龟是刺颈龟属中体型最大的一种，其头部大而宽，无法缩入壳中，只能弯曲收于体侧。鼻吻处略钝，下巴处有2枚小胡须。头颈部上部皮肤呈灰棕色，下部呈奶油色或黄色。
头部覆盖有大块鳞片，颈部与四肢处分布有突起的圆锥形结节。甲壳呈椭圆形，体型较宽，为浅棕色、深褐色或黑褐色。腹甲黄色，甲缝处颜色较深。幼年时甲壳上可能有棕色辐射纹，背甲边缘、腹甲及颈部两侧均有亮丽的橙红色斑块。
巨头刺颈龟是刺颈龟属中体型最大的一种，其头部大而宽，无法缩入壳中，只能弯曲收于体侧。鼻吻处略钝，下巴处有2枚小胡须。头颈部上部皮肤呈灰棕色，下部呈奶油色或黄色。
头部覆盖有大块鳞片，颈部与四肢处分布有突起的圆锥形结节。甲壳呈椭圆形，体型较宽，为浅棕色、深褐色或黑褐色。腹甲黄色，甲缝处颜色较深。幼年时甲壳上可能有棕色辐射纹，背甲边缘、腹甲及颈部两侧均有亮丽的橙红色斑块。