眼睛是猫科动物中一项独特的特征，其颜色由两个主要原因引起：虹膜色素沉淀和蓝光反射。虹膜色素沉淀由黑色素引起，颜色从柠檬黄到淡褐色再到深橙色或棕色不等。另外，猫科动物的眼睛结构类似于透明的玻璃，能够反射外来光线。当我们从不同角度观察玻璃时，它呈现出绿色或蓝色。同样地，猫科动物的眼睛结构也呈现出透明的蓝色，从无色到深蓝色或紫罗兰蓝色不等。这种蓝色光线的反射与虹膜色素沉淀共同构成了猫的眼睛颜色。
虹膜色素沉淀和透明结构色素都由染色体上的多个多基因控制。同一窝的小猫从父母那里混合继承了这些多基因，并且产生了不同的眼睛颜色。不同的多基因组合导致了颜色深浅的差异。幼猫出生时都有蓝眼睛，而成猫的眼睛颜色在六七周大时定型，有些可能要到三四个月大时才固定下来。在猫的一生中，疾病和伤害可能导致眼睛颜色的变化，但喂鱼并不会改变猫的眼睛颜色。这种说法是错误的，因为在喂鱼的时候正是小猫眼睛颜色变化的时期。蓝色眼睛只是幼猫时期的一个特征，在大多数品种中，在六周后会被另一种颜色所替代。
蓝眼睛是重点色猫的一个特征，与温白化病相关，这种病导致了重点色图案的产生。蓝眼睛的亮度变化需要繁育者选择眼睛颜色最好的猫进行繁育，以产生更理想的蓝眼睛重点色幼猫。蓝眼睛也出现在纯白猫或携带显性纯白色基因的猫中，但这与白化病是不同的。白色基因只是掩盖了潜在的颜色，如果白斑出现在眼睛周围，会影响眼睛色素。白猫可能有一只或两只蓝眼睛，而非蓝眼的白猫的眼睛颜色可以是品种标准中的任何颜色。
除了蓝眼睛外，绿色和浅绿色也是一些猫眼睛的颜色。绿色的颜色从微黄绿到深绿甚至带有蓝色调。一些品种像金吉拉波斯和异短以及东奇尼猫都以其深绿色眼睛而闻名。黄色、橙色/琥珀色和棕色是另一系列的眼睛颜色。黄色的范围从淡柠檬黄到更鲜艳的色调。棕色则包含了从淡褐色到黑棕色的广泛范围。有时候棕色眼睛会带有绿色、黄色或橙色的斑点。鸳鸯眼是指一只眼睛是蓝色的，另一只眼睛是其他颜色的。这种特征在白显性猫中最常见，其中一只眼睛是蓝色的，另一只眼睛可以是黄色、橙色、棕色或绿色。一些白猫有两只蓝眼睛，但在照相时可能因闪光灯的反射而出现绿色或红色。不常见的是，其他颜色的猫也可能有鸳鸯眼，如玳瑁猫一只眼睛是黄色，另一只眼睛是蓝色。
有一些猫的眼睛会出现两种颜色的虹膜。例如，一个眼睛的虹膜可能是黄色，而另一个眼睛的虹膜可能是绿色。这种情况在猫展中被认为是错误的，但却非常吸引人。此外，有些猫的眼睛可能呈现出粉红色，这是由于白化病引起的，粉红眼睛是由于眼睛色素缺乏而导致的。尽管眼睛结构不同一直被认为不可能出现粉红色眼睛的猫，但最近几年已经有几只粉红眼睛的白化病猫被报道。除了白化病，眼睛颜色可以受伤害或疾病影响而改变。具有粉红色眼睛的猫是非常罕见的，这种情况与其他颜色的猫不同。
猫的眼睛颜色受到虹膜色素沉淀和透明结构色素的影响。不同的基因组合和突变会导致眼睛颜色的变化，使每只猫都具有独特的眼睛颜色。这些颜色包括蓝色、绿色、黄色、橙色、棕色和鸳鸯眼等。了解猫眼睛颜色的形成原因可以帮助我们更好地欣赏和理解这些可爱的动物。
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