欧洲泽龟是国家保护动物，欧洲泽龟被列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》(IUCN 1996年 ver 2.3)—近危(NT)。
欧洲种群列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》(IUCN 2004年 ver 3.1)—近危(NT)。
栖息地丧失的影响被认为是该物种数量减少的关键因素：城市化、道路建设、湿地排水(Atatur，1995;Servan，1995)。该物种对水污染敏感，水污染被认为是该物种局部消失的一个因素(Atatur 1995;Servan 1995;Mascort 1996)。
由于受到外来物种巴西彩龟(Trachemys scripta)的影响，该物种被认为特别危险，因为巴西彩龟会与它们争夺食物、晒太阳地点和筑巢地点。食品和宠物贸易的收集对其已经产生了历史性的影响，并且在某些地方仍在继续，但这并不是对整个物种的主要威胁。水资源的过度开发和盐碱化使其可利用栖息地不断减少。
欧洲泽龟在其分布的绝大多数国家中都受到保护。1979年的《伯尔尼公约》(欧洲野生动植物物种保护法)禁止该物种的市场交易。此外，该物种还受到欧盟92/43号《生境法》的保护，并受到意大利D.P.R.(共和国总统令，n.357，1997)的保护。在利古里亚地区，欧洲泽龟由1992年1月22日的L.R.(地区法)n.4保护(由D.P.R.n.120于2003年修订)，该法律保护动物群，特别是两栖和爬行动物。
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