真鳄龟不可以深水养，人工养殖的真鳄龟品种，虽然从原则上来说也属于深水龟，不过饲养真鳄龟的水位不宜太高，水最好不要太深了。
深水龟和浅水龟是两种习性不同的乌龟品种。真鳄龟属于一种深水龟。野生的品种会生活在水比较深的水域中，不会对它们的身体造成危害。不过，人工养殖的品种虽然原则上来说也属于深水龟，不过水位不宜太高，水最好不要太深了。
一般来说，可以将水位高度调节到真鳄龟的背壳高度2倍左右的地方，这样的高度比较合适，可以让它们比较容易地将头探出水面呼吸。如果水非常深的话，可能会对真鳄龟造成一定的危害，因此需要避免。尤其是在大鳄龟处于龟苗时期的时候，此时它们的适应性不是太好，需要特别注意一下。随着它们的长大，体型也会慢慢变大，此时可以根据它们的体型来调节水位，合理控制水位。