吉娃娃属于小型犬种，因此它们也容易患上小型犬种常易出现的疾病，例如是膝盖骨脱臼、牙周病、气管塌陷等。
【1】气管塌陷
如果吉娃娃最近一直发出类似咳嗽的声音，但尾音会更高，有如鹅叫般，这可能是出现气管塌陷。气管塌陷症状，常发生在小型犬与短鼻犬种身上，无论是先天或后天，都有可能并发此症。
【2】牙周病
狗狗和人类一样，如果口腔不洁，便有机会出现牙周病，轻则替狗狗刷牙时易出血，严重的话牙齿会鬆动脱落。不只是吉娃娃会较易患上牙周病，许多小型犬种同样易患上。这是因为我们在喂饲小型犬种时，多会给予较柔较软的饲料，而且还经常给零食小狗。这些细小的食物，容易藏在牙缝里不易清理乾淨，结果食物残渣和细菌滋生混合，造成口臭及牙周病。
【3】角膜炎
由于吉娃娃眼睛比较突出，而且一般喜欢跳跃，因此容易弄伤眼睛位置。角膜炎通常是由于异物入眼而造成，例如洗毛液沾了在眼睛附近位置未有冲洗干淨、眼睫毛跑进眼眼、经过草地时擦伤眼部，分泌物积累没有好好清洁等。另外，如果与其他狗狗打架或被异物刮损眼角膜，亦会引致角膜炎，造成眼睛畏光、充血及红肿等情况。
【4】水脑症
水脑症是指头盖骨中，脑室里脑脊髓液过度蓄积，从而压迫到脑部的疾病。由于大脑被过多脑脊髓液压迫着，令肢体操控易产生障碍。许多吉娃娃都有这个先天的问题，而如果脑部曾受创伤，也可能出现水脑症。
【5】膝盖骨脱臼
同样是先天问题，膝盖骨脱臼常出现在吉娃娃身上。膝盖骨脱臼症状可分4个等级：
「等级1至2」：膝关节虽然有不稳定的情况，但不太容易察觉出异常，就算是脱臼，也可轻易自行回复，狗狗没有明显痛楚表现，因此常被忽略。
「等级3至4」：吉娃娃会有异常举动，例如走路时突然后缩起后腿、踢腿、走路一跛一跛等。问题更严重时，会出现没法正常走路，走路时出现痛楚样子，或不愿走路等情况。