水田鼠是可以训练的，但是水田鼠和猫狗比起来，是比较不容易和主人取得沟通的。所以主人在训练水田鼠的时候需要有耐心，而且水田鼠的训练项目有很多，比如最常见的训练水田鼠学会在便盆里上厕所：
1、将水田鼠笼里的垫材全部换掉，就是不能留有水田鼠原来的气味，换上全新的垫材。
2、把水田鼠放在鼠笼里，仔细观察，如果发现水田鼠随地尿尿的话，就轻轻惩罚，然后再将水田鼠赶到厕所去。 如此几次后，一般水田鼠都能被训练成定点尿尿了。以后打扫水田鼠笼的时候，只要重点清理水田鼠厕所就好了，水田鼠笼的垫材不用换的那么勤快，也不用频繁地大面积更换。