凹甲陆龟常见寄生虫病即阿米巴原虫感染。病龟精神差，喜泡水或漂浮于水面，吃食废绝，拉稀，粪便恶臭。病死龟解剖见消化道黏膜出血或溃疡，亦有肝脏病变。治疗办法：芬苯达唑剂量：100毫克/千克，每周使用1次，连续2-3次：甲硝唑剂量：50毫克/千克，每天1次，连续使用3天，两周后再重复；百病消片剂，口服，每天1次，2周为1个疗程，使用2-3个疗程。
凹甲陆龟红眼病的病因通常是鼻腔内病菌感染引起，表现为鼻、脸及眼部红肿，严重者影响动物采食和生长。治疗方法：采用环丙沙星滴剂滴入鼻腔和眼部，1天2-3次，连续使用2-3周可治愈。
凹甲陆龟呼吸道疾病，治疗采用百病消按5毫克/千克，1天1次或10毫克/千克2天1次给药，对不能自主采食的病龟，要人工填食，以保证其体力，增强体质，从而增强机体的抗病能力。通常情况下，要3-4周可治愈。