牟氏水龟是一种杂食动物，比较倾向肉食性，主要以鱼、虾、贝类、昆虫、蜗牛、蚯蚓等做为日常食物，偶尔也会摄取水生植物或浆果类食物。需要注意的是牟氏水龟胆子比较小，换一个环境很可能会造成不进食。
牟氏水龟在野外通常以莓果、水萍以及各种昆虫和动物残肉为食，牟氏水龟在日间觅食，但在最热的时间不怎么活跃，它们主要吃种子、草莓、昆虫、蛞蝓、蠕虫及淡水龙虾。并且可以在水中，陆上同时进食，是一种更加陆地化的水龟。
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